电力变压器效率降低。配变在三相负载不平衡工况下运行，将引起输出电压三相不平衡。由于不平衡电压存在着正序、负序、零序三个电压分量，当这种不平衡的电压输入电力变压器后，负序电压产生旋转磁场与正序电压产生的旋转磁场相反，起到制动作用。但由于正序磁场比负序磁场要强得多，电力变压器仍按正序磁场方向转动。而由于负序磁场的制动作用，必将引起电力变压器输出功率减少，从而导致电力变压器效率降低。
社会的飞速发展，计算机也在不断的发展，而对电力变压器波过程进行数值的计算已经有了结果，只要进行合理的选择计算模型和方法，计算的结果的精准性是可以满足工程设计的要求的，采用合理的数值法不仅在设计阶段可以比较准确的确定电力变压器的电压分布，并且可以在一定的范围内合理的布置和安排电力变压器 的绕组等结构，大大的方便了电力变压器的设计，从而也保证了运行的可靠性。在用数值法计算电力变压器的绕组波的过程的时候，我们通常会把电力变压器的绕组划分为若干个单元，而它的每个单元用一个等值的电路来代替，而它的电路包含了一个电感及纵向电容、一个对地电容或者绕组间的电容，它们各个单元电感间还存在着互感，并采集链形网络作为电力变压器的等值电路所得结果的精度完全可以满足实际工程的需要。
同时，电力变压器的温升和无功损耗，也将随三相电压的不平衡度而增大。所以电力变压器在三相电压不平衡状况下运行，是非常不经济和不安全的。同时，配变在三相负载不平衡时运行，三相输出电流不一样，而中性线就会有电流通过。因而使中性线产生阻抗压降，从而导致中性点漂移，致使各相相电压发生变化。负载重的一相电压降低，而负载轻的一相电压升高。在电压不平衡状况下供电，即容易造成电压高的一相接带的用户用电设备烧坏，而电压低的一相接带的用户用电设备则可能无法使用。所以三相负载不平衡运行时，将严重危及用电设备的安全运行。
